研发费用真实性存疑，研发费大于管理费或占比过高。

研发费归集不合理。

如：研发人员人员年均费用远低于一般人员水平，直接投入占研发费总额的比例过高，不同研发项目支出金额、结构完全一样。

例：某信息技术有限公司，近一年销售收入2,000万元，近三个会计年度的研究开发费用总额占销售收入总额的比例为2.84%，其他条件都符合，但因比例为2.84%低于5%就未通过高企认定。

部分工业制造类企业的研发费中，人员人工占研发费用总额的比例过高，超过60%，费用额大。非软件类企业人员人工费比例过高，研发费用归集不合理。

委托外部研发的支出全额计入研发费，未按80%计入研发费。

研发费用中其他费用占比超过20%。

研发费用明细表和研发项目（RD）表不一致。

委托外部研发支出与附件材料产学研合作协议所列不一致，如某研发项目为产学研合作项目，但该项目研发结构明细表中无委托外部研发支出。

研发项目无证明材料，项目立项报告千篇一律，临时拼凑。

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